Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
SMARCA4P51532 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMARCA4P51532 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms