Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FNTAP49354 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNTAP49354 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNTAP49354 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNTAP49354 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNTAP49354 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNTAP49354 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNTAP49354 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNTAP49354 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNTAP49354 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNTAP49354 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNTAP49354 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNTAP49354 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNTAP49354 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNTAP49354 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FNTAP49354 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNTAP49354 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNTAP49354 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNTAP49354 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNTAP49354 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNTAP49354 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNTAP49354 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNTAP49354 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNTAP49354 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNTAP49354 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNTAP49354 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNTAP49354 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNTAP49354 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNTAP49354 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FNTAP49354 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNTAP49354 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FNTAP49354 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNTAP49354 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNTAP49354 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNTAP49354 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNTAP49354 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNTAP49354 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNTAP49354 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNTAP49354 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FNTAP49354 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNTAP49354 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNTAP49354 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNTAP49354 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNTAP49354 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNTAP49354 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNTAP49354 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FNTAP49354 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNTAP49354 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNTAP49354 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNTAP49354 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNTAP49354 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNTAP49354 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNTAP49354 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNTAP49354 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNTAP49354 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNTAP49354 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNTAP49354 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNTAP49354 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNTAP49354 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNTAP49354 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNTAP49354 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNTAP49354 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNTAP49354 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNTAP49354 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNTAP49354 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNTAP49354 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNTAP49354 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FNTAP49354 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNTAP49354 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNTAP49354 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNTAP49354 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNTAP49354 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNTAP49354 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNTAP49354 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNTAP49354 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNTAP49354 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNTAP49354 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNTAP49354 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNTAP49354 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNTAP49354 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNTAP49354 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNTAP49354 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FNTAP49354 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FNTAP49354 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNTAP49354 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNTAP49354 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNTAP49354 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNTAP49354 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNTAP49354 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNTAP49354 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNTAP49354 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNTAP49354 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNTAP49354 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNTAP49354 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNTAP49354 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNTAP49354 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FNTAP49354 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNTAP49354 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNTAP49354 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNTAP49354 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms