Protein–RNA interactions for Protein: P48556

PSMD8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD8P48556 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms