Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms