Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UTRNP46939 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UTRNP46939 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UTRNP46939 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UTRNP46939 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UTRNP46939 RPS18P9-201ENST00000482817 460 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
UTRNP46939 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
UTRNP46939 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UTRNP46939 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
UTRNP46939 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UTRNP46939 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UTRNP46939 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UTRNP46939 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
UTRNP46939 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UTRNP46939 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UTRNP46939 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UTRNP46939 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UTRNP46939 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTRNP46939 CFL1P6-201ENST00000400899 494 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
UTRNP46939 LINC01983-201ENST00000413586 574 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTRNP46939 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTRNP46939 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTRNP46939 BCRP4-201ENST00000506079 804 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
UTRNP46939 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTRNP46939 ZNF671-203ENST00000596939 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTRNP46939 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTRNP46939 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTRNP46939 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTRNP46939 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTRNP46939 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTRNP46939 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTRNP46939 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
UTRNP46939 AC092570.1-201ENST00000414446 469 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
UTRNP46939 CDK2-203ENST00000440311 1031 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTRNP46939 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTRNP46939 AC009163.5-202ENST00000571737 466 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTRNP46939 AC006116.2-201ENST00000589958 988 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
UTRNP46939 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
UTRNP46939 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
UTRNP46939 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTRNP46939 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTRNP46939 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTRNP46939 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTRNP46939 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTRNP46939 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTRNP46939 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTRNP46939 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTRNP46939 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTRNP46939 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTRNP46939 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTRNP46939 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTRNP46939 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTRNP46939 AC098657.1-201ENST00000416270 1135 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
UTRNP46939 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTRNP46939 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTRNP46939 AC021321.1-201ENST00000607397 1113 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
UTRNP46939 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTRNP46939 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
UTRNP46939 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTRNP46939 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTRNP46939 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTRNP46939 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTRNP46939 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTRNP46939 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTRNP46939 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
UTRNP46939 AC005993.1-201ENST00000555581 397 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTRNP46939 KLKP1-202ENST00000597246 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTRNP46939 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTRNP46939 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTRNP46939 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTRNP46939 AL356417.1-201ENST00000421161 845 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTRNP46939 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
UTRNP46939 CADM1-221ENST00000612235 1042 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTRNP46939 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTRNP46939 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTRNP46939 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTRNP46939 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTRNP46939 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTRNP46939 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTRNP46939 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTRNP46939 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTRNP46939 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTRNP46939 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTRNP46939 AQP7-202ENST00000377425 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTRNP46939 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTRNP46939 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTRNP46939 AP006248.1-201ENST00000610471 67 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
UTRNP46939 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTRNP46939 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UTRNP46939 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UTRNP46939 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UTRNP46939 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UTRNP46939 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UTRNP46939 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UTRNP46939 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UTRNP46939 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UTRNP46939 KCTD6-205ENST00000490264 1759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UTRNP46939 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UTRNP46939 PLA2G2A-201ENST00000375111 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UTRNP46939 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms