Protein–RNA interactions for Protein: P43005

SLC1A1, Excitatory amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A1P43005 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC1A1P43005 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms