Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms