Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PPARGP37231 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PPARGP37231 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PPARGP37231 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PPARGP37231 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PPARGP37231 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PPARGP37231 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PPARGP37231 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PPARGP37231 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PPARGP37231 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PPARGP37231 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PPARGP37231 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PPARGP37231 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PPARGP37231 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PPARGP37231 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PPARGP37231 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PPARGP37231 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PPARGP37231 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PPARGP37231 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PPARGP37231 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PPARGP37231 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PPARGP37231 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PPARGP37231 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PPARGP37231 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PPARGP37231 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PPARGP37231 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PPARGP37231 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PPARGP37231 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PPARGP37231 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PPARGP37231 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PPARGP37231 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PPARGP37231 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PPARGP37231 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PPARGP37231 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PPARGP37231 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PPARGP37231 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PPARGP37231 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PPARGP37231 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PPARGP37231 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PPARGP37231 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PPARGP37231 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PPARGP37231 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PPARGP37231 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PPARGP37231 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PPARGP37231 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PPARGP37231 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PPARGP37231 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PPARGP37231 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PPARGP37231 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PPARGP37231 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PPARGP37231 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PPARGP37231 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PPARGP37231 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PPARGP37231 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PPARGP37231 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PPARGP37231 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PPARGP37231 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PPARGP37231 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PPARGP37231 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PPARGP37231 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PPARGP37231 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PPARGP37231 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PPARGP37231 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PPARGP37231 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PPARGP37231 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PPARGP37231 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PPARGP37231 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PPARGP37231 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PPARGP37231 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PPARGP37231 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PPARGP37231 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PPARGP37231 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PPARGP37231 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PPARGP37231 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PPARGP37231 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PPARGP37231 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PPARGP37231 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PPARGP37231 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PPARGP37231 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PPARGP37231 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PPARGP37231 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PPARGP37231 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PPARGP37231 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PPARGP37231 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PPARGP37231 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PPARGP37231 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PPARGP37231 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PPARGP37231 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PPARGP37231 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PPARGP37231 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PPARGP37231 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PPARGP37231 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PPARGP37231 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PPARGP37231 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PPARGP37231 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PPARGP37231 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PPARGP37231 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PPARGP37231 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PPARGP37231 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PPARGP37231 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms