Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

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Length 558 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GPC1P35052 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GPC1P35052 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GPC1P35052 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
GPC1P35052 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GPC1P35052 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GPC1P35052 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GPC1P35052 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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GPC1P35052 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GPC1P35052 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GPC1P35052 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GPC1P35052 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GPC1P35052 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GPC1P35052 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GPC1P35052 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GPC1P35052 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GPC1P35052 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GPC1P35052 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GPC1P35052 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GPC1P35052 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GPC1P35052 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GPC1P35052 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GPC1P35052 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GPC1P35052 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GPC1P35052 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GPC1P35052 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
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GPC1P35052 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GPC1P35052 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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GPC1P35052 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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GPC1P35052 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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GPC1P35052 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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GPC1P35052 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GPC1P35052 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GPC1P35052 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GPC1P35052 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GPC1P35052 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GPC1P35052 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GPC1P35052 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GPC1P35052 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GPC1P35052 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GPC1P35052 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GPC1P35052 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GPC1P35052 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GPC1P35052 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GPC1P35052 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GPC1P35052 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GPC1P35052 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GPC1P35052 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GPC1P35052 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GPC1P35052 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GPC1P35052 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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