Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms