Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CNGA1P29973 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNGA1P29973 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNGA1P29973 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNGA1P29973 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNGA1P29973 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNGA1P29973 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNGA1P29973 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CNGA1P29973 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNGA1P29973 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNGA1P29973 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNGA1P29973 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNGA1P29973 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNGA1P29973 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNGA1P29973 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNGA1P29973 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNGA1P29973 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNGA1P29973 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNGA1P29973 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNGA1P29973 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNGA1P29973 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNGA1P29973 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNGA1P29973 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNGA1P29973 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNGA1P29973 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNGA1P29973 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNGA1P29973 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNGA1P29973 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNGA1P29973 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNGA1P29973 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNGA1P29973 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNGA1P29973 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNGA1P29973 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNGA1P29973 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNGA1P29973 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNGA1P29973 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CNGA1P29973 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNGA1P29973 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNGA1P29973 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNGA1P29973 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNGA1P29973 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNGA1P29973 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNGA1P29973 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNGA1P29973 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNGA1P29973 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNGA1P29973 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNGA1P29973 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNGA1P29973 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CNGA1P29973 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CNGA1P29973 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNGA1P29973 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CNGA1P29973 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNGA1P29973 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNGA1P29973 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CNGA1P29973 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNGA1P29973 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNGA1P29973 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNGA1P29973 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNGA1P29973 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNGA1P29973 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNGA1P29973 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNGA1P29973 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNGA1P29973 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNGA1P29973 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNGA1P29973 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNGA1P29973 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNGA1P29973 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNGA1P29973 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNGA1P29973 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNGA1P29973 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNGA1P29973 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNGA1P29973 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNGA1P29973 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNGA1P29973 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNGA1P29973 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNGA1P29973 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNGA1P29973 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNGA1P29973 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNGA1P29973 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNGA1P29973 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNGA1P29973 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNGA1P29973 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNGA1P29973 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNGA1P29973 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNGA1P29973 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNGA1P29973 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNGA1P29973 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNGA1P29973 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNGA1P29973 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNGA1P29973 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNGA1P29973 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNGA1P29973 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNGA1P29973 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNGA1P29973 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNGA1P29973 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CNGA1P29973 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNGA1P29973 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNGA1P29973 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNGA1P29973 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNGA1P29973 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms