Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GCAP28676 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GCAP28676 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GCAP28676 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GCAP28676 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GCAP28676 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GCAP28676 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GCAP28676 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GCAP28676 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GCAP28676 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GCAP28676 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GCAP28676 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GCAP28676 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GCAP28676 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GCAP28676 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GCAP28676 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GCAP28676 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GCAP28676 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GCAP28676 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GCAP28676 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GCAP28676 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GCAP28676 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GCAP28676 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GCAP28676 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GCAP28676 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GCAP28676 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GCAP28676 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GCAP28676 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GCAP28676 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GCAP28676 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GCAP28676 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GCAP28676 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GCAP28676 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GCAP28676 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GCAP28676 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GCAP28676 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GCAP28676 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GCAP28676 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GCAP28676 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GCAP28676 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GCAP28676 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GCAP28676 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GCAP28676 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GCAP28676 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GCAP28676 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GCAP28676 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GCAP28676 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GCAP28676 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GCAP28676 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GCAP28676 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GCAP28676 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GCAP28676 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GCAP28676 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GCAP28676 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GCAP28676 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GCAP28676 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GCAP28676 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GCAP28676 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GCAP28676 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GCAP28676 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GCAP28676 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GCAP28676 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GCAP28676 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GCAP28676 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GCAP28676 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GCAP28676 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GCAP28676 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GCAP28676 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GCAP28676 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GCAP28676 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GCAP28676 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GCAP28676 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GCAP28676 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GCAP28676 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GCAP28676 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GCAP28676 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GCAP28676 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GCAP28676 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GCAP28676 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GCAP28676 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GCAP28676 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GCAP28676 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GCAP28676 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GCAP28676 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GCAP28676 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GCAP28676 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GCAP28676 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GCAP28676 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GCAP28676 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GCAP28676 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GCAP28676 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GCAP28676 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GCAP28676 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GCAP28676 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GCAP28676 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GCAP28676 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GCAP28676 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GCAP28676 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GCAP28676 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GCAP28676 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms