Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms