Protein–RNA interactions for Protein: P19838

NFKB1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB1P19838 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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NFKB1P19838 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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NFKB1P19838 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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NFKB1P19838 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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NFKB1P19838 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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NFKB1P19838 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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NFKB1P19838 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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NFKB1P19838 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
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NFKB1P19838 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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