Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms