Protein–RNA interactions for Protein: P18858

LIG1, DNA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG1P18858 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LIG1P18858 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LIG1P18858 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LIG1P18858 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LIG1P18858 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LIG1P18858 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LIG1P18858 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LIG1P18858 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LIG1P18858 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LIG1P18858 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LIG1P18858 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LIG1P18858 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
LIG1P18858 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LIG1P18858 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
LIG1P18858 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LIG1P18858 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LIG1P18858 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LIG1P18858 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LIG1P18858 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LIG1P18858 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LIG1P18858 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LIG1P18858 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LIG1P18858 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LIG1P18858 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LIG1P18858 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LIG1P18858 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
LIG1P18858 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
LIG1P18858 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
LIG1P18858 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LIG1P18858 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LIG1P18858 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LIG1P18858 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LIG1P18858 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LIG1P18858 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LIG1P18858 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LIG1P18858 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LIG1P18858 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LIG1P18858 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LIG1P18858 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LIG1P18858 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LIG1P18858 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LIG1P18858 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LIG1P18858 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
LIG1P18858 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
LIG1P18858 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LIG1P18858 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LIG1P18858 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LIG1P18858 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LIG1P18858 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LIG1P18858 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LIG1P18858 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LIG1P18858 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LIG1P18858 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LIG1P18858 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LIG1P18858 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LIG1P18858 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LIG1P18858 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LIG1P18858 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LIG1P18858 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LIG1P18858 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
LIG1P18858 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LIG1P18858 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LIG1P18858 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LIG1P18858 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LIG1P18858 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LIG1P18858 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LIG1P18858 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LIG1P18858 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LIG1P18858 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LIG1P18858 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LIG1P18858 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LIG1P18858 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LIG1P18858 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LIG1P18858 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LIG1P18858 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LIG1P18858 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LIG1P18858 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LIG1P18858 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LIG1P18858 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LIG1P18858 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LIG1P18858 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LIG1P18858 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LIG1P18858 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LIG1P18858 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LIG1P18858 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LIG1P18858 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LIG1P18858 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LIG1P18858 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LIG1P18858 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LIG1P18858 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LIG1P18858 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LIG1P18858 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LIG1P18858 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LIG1P18858 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LIG1P18858 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LIG1P18858 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LIG1P18858 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LIG1P18858 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LIG1P18858 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LIG1P18858 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms