Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms