Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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