Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms