Protein–RNA interactions for Protein: P10911

MCF2, Proto-oncogene DBL, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2P10911 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCF2P10911 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCF2P10911 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCF2P10911 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCF2P10911 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCF2P10911 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCF2P10911 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCF2P10911 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCF2P10911 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCF2P10911 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCF2P10911 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCF2P10911 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCF2P10911 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCF2P10911 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCF2P10911 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCF2P10911 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCF2P10911 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCF2P10911 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCF2P10911 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCF2P10911 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCF2P10911 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCF2P10911 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCF2P10911 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCF2P10911 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCF2P10911 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCF2P10911 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCF2P10911 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCF2P10911 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
MCF2P10911 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCF2P10911 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
MCF2P10911 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCF2P10911 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCF2P10911 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCF2P10911 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCF2P10911 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCF2P10911 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCF2P10911 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCF2P10911 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCF2P10911 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCF2P10911 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCF2P10911 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCF2P10911 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCF2P10911 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCF2P10911 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCF2P10911 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCF2P10911 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCF2P10911 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCF2P10911 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCF2P10911 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCF2P10911 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCF2P10911 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCF2P10911 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCF2P10911 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MCF2P10911 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
MCF2P10911 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
MCF2P10911 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MCF2P10911 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
MCF2P10911 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.25
MCF2P10911 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
MCF2P10911 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MCF2P10911 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MCF2P10911 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MCF2P10911 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MCF2P10911 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MCF2P10911 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MCF2P10911 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MCF2P10911 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MCF2P10911 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MCF2P10911 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MCF2P10911 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MCF2P10911 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MCF2P10911 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MCF2P10911 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MCF2P10911 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MCF2P10911 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MCF2P10911 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MCF2P10911 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MCF2P10911 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MCF2P10911 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MCF2P10911 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MCF2P10911 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MCF2P10911 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MCF2P10911 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MCF2P10911 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MCF2P10911 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MCF2P10911 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MCF2P10911 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MCF2P10911 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MCF2P10911 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MCF2P10911 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MCF2P10911 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCF2P10911 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCF2P10911 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCF2P10911 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCF2P10911 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCF2P10911 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCF2P10911 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCF2P10911 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCF2P10911 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCF2P10911 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms