Protein–RNA interactions for Protein: P0CJ79

ZNF888, Zinc finger protein 888, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF888P0CJ79 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF888P0CJ79 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF888P0CJ79 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF888P0CJ79 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF888P0CJ79 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF888P0CJ79 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF888P0CJ79 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF888P0CJ79 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF888P0CJ79 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF888P0CJ79 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF888P0CJ79 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF888P0CJ79 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF888P0CJ79 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF888P0CJ79 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF888P0CJ79 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF888P0CJ79 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF888P0CJ79 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF888P0CJ79 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF888P0CJ79 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF888P0CJ79 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF888P0CJ79 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF888P0CJ79 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF888P0CJ79 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF888P0CJ79 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF888P0CJ79 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF888P0CJ79 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF888P0CJ79 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF888P0CJ79 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF888P0CJ79 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF888P0CJ79 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF888P0CJ79 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF888P0CJ79 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF888P0CJ79 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF888P0CJ79 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF888P0CJ79 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF888P0CJ79 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF888P0CJ79 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF888P0CJ79 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF888P0CJ79 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF888P0CJ79 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF888P0CJ79 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF888P0CJ79 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF888P0CJ79 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF888P0CJ79 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF888P0CJ79 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF888P0CJ79 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF888P0CJ79 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF888P0CJ79 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF888P0CJ79 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF888P0CJ79 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF888P0CJ79 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF888P0CJ79 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF888P0CJ79 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF888P0CJ79 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF888P0CJ79 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF888P0CJ79 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF888P0CJ79 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF888P0CJ79 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF888P0CJ79 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF888P0CJ79 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF888P0CJ79 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF888P0CJ79 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF888P0CJ79 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF888P0CJ79 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF888P0CJ79 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF888P0CJ79 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF888P0CJ79 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF888P0CJ79 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF888P0CJ79 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF888P0CJ79 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF888P0CJ79 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF888P0CJ79 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF888P0CJ79 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF888P0CJ79 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF888P0CJ79 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF888P0CJ79 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF888P0CJ79 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF888P0CJ79 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF888P0CJ79 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF888P0CJ79 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF888P0CJ79 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF888P0CJ79 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF888P0CJ79 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF888P0CJ79 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF888P0CJ79 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF888P0CJ79 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF888P0CJ79 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF888P0CJ79 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF888P0CJ79 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF888P0CJ79 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF888P0CJ79 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF888P0CJ79 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF888P0CJ79 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF888P0CJ79 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF888P0CJ79 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF888P0CJ79 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF888P0CJ79 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF888P0CJ79 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF888P0CJ79 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF888P0CJ79 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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