Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

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Length 187 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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