Protein–RNA interactions for Protein: O95352

ATG7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7O95352 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG7O95352 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG7O95352 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG7O95352 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG7O95352 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG7O95352 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG7O95352 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG7O95352 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG7O95352 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG7O95352 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG7O95352 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG7O95352 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG7O95352 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG7O95352 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG7O95352 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG7O95352 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG7O95352 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG7O95352 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG7O95352 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG7O95352 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG7O95352 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG7O95352 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG7O95352 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG7O95352 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG7O95352 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG7O95352 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG7O95352 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG7O95352 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG7O95352 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG7O95352 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG7O95352 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG7O95352 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG7O95352 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG7O95352 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG7O95352 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG7O95352 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG7O95352 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG7O95352 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG7O95352 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG7O95352 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG7O95352 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG7O95352 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG7O95352 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG7O95352 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG7O95352 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG7O95352 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG7O95352 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG7O95352 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG7O95352 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG7O95352 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG7O95352 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG7O95352 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG7O95352 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG7O95352 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG7O95352 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG7O95352 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG7O95352 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG7O95352 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG7O95352 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG7O95352 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG7O95352 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG7O95352 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG7O95352 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG7O95352 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG7O95352 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG7O95352 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG7O95352 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG7O95352 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG7O95352 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG7O95352 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG7O95352 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG7O95352 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG7O95352 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG7O95352 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG7O95352 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG7O95352 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG7O95352 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG7O95352 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG7O95352 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG7O95352 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG7O95352 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG7O95352 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG7O95352 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG7O95352 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG7O95352 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG7O95352 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG7O95352 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG7O95352 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG7O95352 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG7O95352 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG7O95352 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG7O95352 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG7O95352 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG7O95352 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG7O95352 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG7O95352 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATG7O95352 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATG7O95352 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATG7O95352 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATG7O95352 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms