Protein–RNA interactions for Protein: O94855

SEC24D, Protein transport protein Sec24D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24DO94855 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC24DO94855 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC24DO94855 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC24DO94855 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC24DO94855 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC24DO94855 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC24DO94855 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC24DO94855 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC24DO94855 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC24DO94855 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC24DO94855 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC24DO94855 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC24DO94855 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC24DO94855 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC24DO94855 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC24DO94855 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC24DO94855 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC24DO94855 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC24DO94855 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC24DO94855 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC24DO94855 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC24DO94855 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC24DO94855 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC24DO94855 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC24DO94855 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC24DO94855 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC24DO94855 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC24DO94855 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC24DO94855 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC24DO94855 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC24DO94855 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC24DO94855 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC24DO94855 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC24DO94855 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC24DO94855 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC24DO94855 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC24DO94855 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC24DO94855 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SEC24DO94855 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SEC24DO94855 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SEC24DO94855 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SEC24DO94855 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
SEC24DO94855 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SEC24DO94855 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SEC24DO94855 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SEC24DO94855 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SEC24DO94855 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SEC24DO94855 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEC24DO94855 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SEC24DO94855 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEC24DO94855 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SEC24DO94855 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SEC24DO94855 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEC24DO94855 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SEC24DO94855 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEC24DO94855 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEC24DO94855 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEC24DO94855 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEC24DO94855 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SEC24DO94855 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SEC24DO94855 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SEC24DO94855 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SEC24DO94855 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SEC24DO94855 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SEC24DO94855 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SEC24DO94855 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SEC24DO94855 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SEC24DO94855 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEC24DO94855 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEC24DO94855 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SEC24DO94855 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEC24DO94855 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SEC24DO94855 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SEC24DO94855 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SEC24DO94855 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SEC24DO94855 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEC24DO94855 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEC24DO94855 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SEC24DO94855 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEC24DO94855 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEC24DO94855 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEC24DO94855 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SEC24DO94855 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SEC24DO94855 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEC24DO94855 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SEC24DO94855 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SEC24DO94855 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEC24DO94855 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SEC24DO94855 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SEC24DO94855 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SEC24DO94855 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEC24DO94855 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEC24DO94855 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEC24DO94855 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEC24DO94855 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEC24DO94855 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SEC24DO94855 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SEC24DO94855 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEC24DO94855 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEC24DO94855 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms