Protein–RNA interactions for Protein: O75962

TRIO, Triple functional domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOO75962 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIOO75962 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIOO75962 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIOO75962 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIOO75962 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIOO75962 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIOO75962 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIOO75962 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIOO75962 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIOO75962 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIOO75962 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIOO75962 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIOO75962 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIOO75962 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIOO75962 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIOO75962 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIOO75962 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIOO75962 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIOO75962 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIOO75962 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIOO75962 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIOO75962 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIOO75962 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIOO75962 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIOO75962 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIOO75962 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIOO75962 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIOO75962 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIOO75962 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIOO75962 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIOO75962 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIOO75962 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIOO75962 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIOO75962 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIOO75962 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIOO75962 RBFOX3-206ENST00000582043 1143 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIOO75962 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIOO75962 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIOO75962 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIOO75962 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIOO75962 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIOO75962 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIOO75962 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIOO75962 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIOO75962 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIOO75962 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIOO75962 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIOO75962 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIOO75962 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIOO75962 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIOO75962 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIOO75962 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIOO75962 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIOO75962 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIOO75962 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIOO75962 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIOO75962 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIOO75962 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIOO75962 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIOO75962 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIOO75962 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIOO75962 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIOO75962 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIOO75962 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIOO75962 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIOO75962 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIOO75962 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIOO75962 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIOO75962 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIOO75962 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIOO75962 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIOO75962 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIOO75962 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIOO75962 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIOO75962 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIOO75962 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIOO75962 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIOO75962 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIOO75962 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIOO75962 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIOO75962 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIOO75962 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIOO75962 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIOO75962 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIOO75962 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIOO75962 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIOO75962 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIOO75962 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIOO75962 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIOO75962 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIOO75962 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIOO75962 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIOO75962 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIOO75962 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIOO75962 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIOO75962 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIOO75962 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIOO75962 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIOO75962 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIOO75962 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms