Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

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Length 271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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