Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms