Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 POLL-201ENST00000299206 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 CASP7-201ENST00000345633 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 MVP-201ENST00000357402 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 GRK7-201ENST00000264952 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 DSN1-201ENST00000373734 1915 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 KCNJ11-201ENST00000339994 2801 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 AL132642.2-201ENST00000623423 1998 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 GNPNAT1-201ENST00000216410 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 RASAL1-201ENST00000261729 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 ACVRL1-206ENST00000550683 4121 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 AC091078.1-202ENST00000543286 2012 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 ANKDD1A-201ENST00000319580 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 DYNC1I1-201ENST00000324972 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 KANK4-201ENST00000317477 2080 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 AC137834.1-201ENST00000548184 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 TRPM4-202ENST00000427978 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 SYMPK-201ENST00000245934 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 DGKZ-220ENST00000532868 3118 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 GOSR2-233ENST00000640068 3103 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 FHOD1-201ENST00000258201 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 XRCC3-202ENST00000553264 3018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 SNIP1-201ENST00000296215 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 PSG8-AS1-201ENST00000425668 1873 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 PIK3R5-220ENST00000623421 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 ITIH5-209ENST00000613909 2916 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 CELF3-202ENST00000290585 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 AC019205.2-203ENST00000421315 3362 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 SRRM5-201ENST00000417606 2381 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 C14orf119-201ENST00000319074 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 POLR3E-219ENST00000615879 3655 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 KCNS2-202ENST00000521839 4340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 DDX5-210ENST00000578804 2021 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms