Protein–RNA interactions for Protein: A0AVT1

UBA6, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA6A0AVT1 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms