Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNS2

COPS3, COP9 signalosome complex subunit 3, humanhuman

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3Q9UNS2 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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