Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN30

SCML1, Sex comb on midleg-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML1Q9UN30 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCML1Q9UN30 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCML1Q9UN30 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCML1Q9UN30 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCML1Q9UN30 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCML1Q9UN30 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCML1Q9UN30 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCML1Q9UN30 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCML1Q9UN30 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCML1Q9UN30 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCML1Q9UN30 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCML1Q9UN30 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCML1Q9UN30 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCML1Q9UN30 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCML1Q9UN30 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCML1Q9UN30 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCML1Q9UN30 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCML1Q9UN30 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCML1Q9UN30 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCML1Q9UN30 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCML1Q9UN30 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SCML1Q9UN30 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCML1Q9UN30 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCML1Q9UN30 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCML1Q9UN30 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCML1Q9UN30 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCML1Q9UN30 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCML1Q9UN30 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCML1Q9UN30 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCML1Q9UN30 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCML1Q9UN30 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCML1Q9UN30 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCML1Q9UN30 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCML1Q9UN30 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCML1Q9UN30 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCML1Q9UN30 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCML1Q9UN30 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SCML1Q9UN30 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCML1Q9UN30 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCML1Q9UN30 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCML1Q9UN30 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCML1Q9UN30 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCML1Q9UN30 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SCML1Q9UN30 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCML1Q9UN30 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCML1Q9UN30 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCML1Q9UN30 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCML1Q9UN30 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCML1Q9UN30 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCML1Q9UN30 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCML1Q9UN30 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCML1Q9UN30 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SCML1Q9UN30 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCML1Q9UN30 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCML1Q9UN30 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCML1Q9UN30 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCML1Q9UN30 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCML1Q9UN30 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCML1Q9UN30 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCML1Q9UN30 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCML1Q9UN30 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCML1Q9UN30 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCML1Q9UN30 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCML1Q9UN30 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCML1Q9UN30 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCML1Q9UN30 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SCML1Q9UN30 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCML1Q9UN30 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCML1Q9UN30 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCML1Q9UN30 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCML1Q9UN30 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCML1Q9UN30 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCML1Q9UN30 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCML1Q9UN30 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCML1Q9UN30 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCML1Q9UN30 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCML1Q9UN30 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCML1Q9UN30 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCML1Q9UN30 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCML1Q9UN30 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCML1Q9UN30 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCML1Q9UN30 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCML1Q9UN30 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCML1Q9UN30 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCML1Q9UN30 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCML1Q9UN30 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCML1Q9UN30 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCML1Q9UN30 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCML1Q9UN30 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCML1Q9UN30 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SCML1Q9UN30 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SCML1Q9UN30 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCML1Q9UN30 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCML1Q9UN30 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCML1Q9UN30 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCML1Q9UN30 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SCML1Q9UN30 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCML1Q9UN30 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCML1Q9UN30 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCML1Q9UN30 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.5 ms