Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT0

TTC7A, Tetratricopeptide repeat protein 7A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC7AQ9ULT0 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTC7AQ9ULT0 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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