Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RABGEF1Q9UJ41 SMIM26-201ENST00000411646 505 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RABGEF1Q9UJ41 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RABGEF1Q9UJ41 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RABGEF1Q9UJ41 SMIM26-202ENST00000435844 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RABGEF1Q9UJ41 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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RABGEF1Q9UJ41 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RABGEF1Q9UJ41 AC121493.1-201ENST00000602316 450 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RABGEF1Q9UJ41 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RABGEF1Q9UJ41 AC027281.2-201ENST00000623856 713 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RABGEF1Q9UJ41 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RABGEF1Q9UJ41 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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RABGEF1Q9UJ41 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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RABGEF1Q9UJ41 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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RABGEF1Q9UJ41 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RABGEF1Q9UJ41 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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RABGEF1Q9UJ41 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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RABGEF1Q9UJ41 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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RABGEF1Q9UJ41 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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RABGEF1Q9UJ41 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RABGEF1Q9UJ41 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RABGEF1Q9UJ41 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RABGEF1Q9UJ41 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RABGEF1Q9UJ41 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RABGEF1Q9UJ41 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RABGEF1Q9UJ41 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RABGEF1Q9UJ41 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RABGEF1Q9UJ41 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RABGEF1Q9UJ41 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
RABGEF1Q9UJ41 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RABGEF1Q9UJ41 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RABGEF1Q9UJ41 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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