Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms