Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
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