Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.3 ms