Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J9

PDP2, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP2Q9P2J9 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDP2Q9P2J9 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDP2Q9P2J9 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDP2Q9P2J9 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDP2Q9P2J9 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PDP2Q9P2J9 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDP2Q9P2J9 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDP2Q9P2J9 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDP2Q9P2J9 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDP2Q9P2J9 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDP2Q9P2J9 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDP2Q9P2J9 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDP2Q9P2J9 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDP2Q9P2J9 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDP2Q9P2J9 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDP2Q9P2J9 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDP2Q9P2J9 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDP2Q9P2J9 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDP2Q9P2J9 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDP2Q9P2J9 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PDP2Q9P2J9 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDP2Q9P2J9 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDP2Q9P2J9 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDP2Q9P2J9 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PDP2Q9P2J9 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PDP2Q9P2J9 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDP2Q9P2J9 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDP2Q9P2J9 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDP2Q9P2J9 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDP2Q9P2J9 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDP2Q9P2J9 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PDP2Q9P2J9 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDP2Q9P2J9 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDP2Q9P2J9 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDP2Q9P2J9 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDP2Q9P2J9 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDP2Q9P2J9 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDP2Q9P2J9 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDP2Q9P2J9 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDP2Q9P2J9 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDP2Q9P2J9 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDP2Q9P2J9 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDP2Q9P2J9 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDP2Q9P2J9 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDP2Q9P2J9 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDP2Q9P2J9 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDP2Q9P2J9 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDP2Q9P2J9 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDP2Q9P2J9 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDP2Q9P2J9 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDP2Q9P2J9 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDP2Q9P2J9 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDP2Q9P2J9 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDP2Q9P2J9 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDP2Q9P2J9 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDP2Q9P2J9 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDP2Q9P2J9 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDP2Q9P2J9 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDP2Q9P2J9 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDP2Q9P2J9 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDP2Q9P2J9 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDP2Q9P2J9 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDP2Q9P2J9 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDP2Q9P2J9 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDP2Q9P2J9 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDP2Q9P2J9 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDP2Q9P2J9 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDP2Q9P2J9 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDP2Q9P2J9 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDP2Q9P2J9 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDP2Q9P2J9 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDP2Q9P2J9 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDP2Q9P2J9 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDP2Q9P2J9 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDP2Q9P2J9 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDP2Q9P2J9 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDP2Q9P2J9 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDP2Q9P2J9 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDP2Q9P2J9 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDP2Q9P2J9 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDP2Q9P2J9 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDP2Q9P2J9 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PDP2Q9P2J9 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDP2Q9P2J9 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDP2Q9P2J9 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDP2Q9P2J9 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDP2Q9P2J9 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDP2Q9P2J9 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PDP2Q9P2J9 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDP2Q9P2J9 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDP2Q9P2J9 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDP2Q9P2J9 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDP2Q9P2J9 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDP2Q9P2J9 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDP2Q9P2J9 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDP2Q9P2J9 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDP2Q9P2J9 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDP2Q9P2J9 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDP2Q9P2J9 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDP2Q9P2J9 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms