Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

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Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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VAPAQ9P0L0 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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VAPAQ9P0L0 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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VAPAQ9P0L0 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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VAPAQ9P0L0 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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VAPAQ9P0L0 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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VAPAQ9P0L0 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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VAPAQ9P0L0 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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VAPAQ9P0L0 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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VAPAQ9P0L0 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
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