Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXG2

THUMPD1, THUMP domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD1Q9NXG2 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
THUMPD1Q9NXG2 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
THUMPD1Q9NXG2 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
THUMPD1Q9NXG2 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
THUMPD1Q9NXG2 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
THUMPD1Q9NXG2 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
THUMPD1Q9NXG2 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
THUMPD1Q9NXG2 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
THUMPD1Q9NXG2 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
THUMPD1Q9NXG2 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
THUMPD1Q9NXG2 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
THUMPD1Q9NXG2 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
THUMPD1Q9NXG2 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
THUMPD1Q9NXG2 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
THUMPD1Q9NXG2 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
THUMPD1Q9NXG2 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
THUMPD1Q9NXG2 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
THUMPD1Q9NXG2 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
THUMPD1Q9NXG2 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
THUMPD1Q9NXG2 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
THUMPD1Q9NXG2 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
THUMPD1Q9NXG2 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
THUMPD1Q9NXG2 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
THUMPD1Q9NXG2 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
THUMPD1Q9NXG2 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
THUMPD1Q9NXG2 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
THUMPD1Q9NXG2 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
THUMPD1Q9NXG2 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
THUMPD1Q9NXG2 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
THUMPD1Q9NXG2 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
THUMPD1Q9NXG2 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
THUMPD1Q9NXG2 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
THUMPD1Q9NXG2 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
THUMPD1Q9NXG2 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
THUMPD1Q9NXG2 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
THUMPD1Q9NXG2 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
THUMPD1Q9NXG2 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
THUMPD1Q9NXG2 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
THUMPD1Q9NXG2 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
THUMPD1Q9NXG2 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
THUMPD1Q9NXG2 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
THUMPD1Q9NXG2 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
THUMPD1Q9NXG2 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
THUMPD1Q9NXG2 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
THUMPD1Q9NXG2 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
THUMPD1Q9NXG2 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
THUMPD1Q9NXG2 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
THUMPD1Q9NXG2 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
THUMPD1Q9NXG2 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
THUMPD1Q9NXG2 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
THUMPD1Q9NXG2 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
THUMPD1Q9NXG2 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
THUMPD1Q9NXG2 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
THUMPD1Q9NXG2 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
THUMPD1Q9NXG2 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
THUMPD1Q9NXG2 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
THUMPD1Q9NXG2 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
THUMPD1Q9NXG2 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
THUMPD1Q9NXG2 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
THUMPD1Q9NXG2 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
THUMPD1Q9NXG2 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
THUMPD1Q9NXG2 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
THUMPD1Q9NXG2 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
THUMPD1Q9NXG2 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
THUMPD1Q9NXG2 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
THUMPD1Q9NXG2 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
THUMPD1Q9NXG2 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
THUMPD1Q9NXG2 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
THUMPD1Q9NXG2 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
THUMPD1Q9NXG2 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
THUMPD1Q9NXG2 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
THUMPD1Q9NXG2 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
THUMPD1Q9NXG2 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
THUMPD1Q9NXG2 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
THUMPD1Q9NXG2 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
THUMPD1Q9NXG2 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
THUMPD1Q9NXG2 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
THUMPD1Q9NXG2 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
THUMPD1Q9NXG2 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
THUMPD1Q9NXG2 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
THUMPD1Q9NXG2 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
THUMPD1Q9NXG2 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
THUMPD1Q9NXG2 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
THUMPD1Q9NXG2 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
THUMPD1Q9NXG2 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
THUMPD1Q9NXG2 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
THUMPD1Q9NXG2 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
THUMPD1Q9NXG2 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
THUMPD1Q9NXG2 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
THUMPD1Q9NXG2 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
THUMPD1Q9NXG2 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
THUMPD1Q9NXG2 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
THUMPD1Q9NXG2 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
THUMPD1Q9NXG2 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
THUMPD1Q9NXG2 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
THUMPD1Q9NXG2 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
THUMPD1Q9NXG2 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
THUMPD1Q9NXG2 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
THUMPD1Q9NXG2 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
THUMPD1Q9NXG2 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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