Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms