Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRA0

SPHK2, Sphingosine kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK2Q9NRA0 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms