Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPA3

MID1IP1, Mid1-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MID1IP1Q9NPA3 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MID1IP1Q9NPA3 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MID1IP1Q9NPA3 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
MID1IP1Q9NPA3 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MID1IP1Q9NPA3 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MID1IP1Q9NPA3 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MID1IP1Q9NPA3 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MID1IP1Q9NPA3 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MID1IP1Q9NPA3 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MID1IP1Q9NPA3 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MID1IP1Q9NPA3 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MID1IP1Q9NPA3 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MID1IP1Q9NPA3 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MID1IP1Q9NPA3 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MID1IP1Q9NPA3 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MID1IP1Q9NPA3 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MID1IP1Q9NPA3 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MID1IP1Q9NPA3 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MID1IP1Q9NPA3 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MID1IP1Q9NPA3 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MID1IP1Q9NPA3 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
MID1IP1Q9NPA3 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MID1IP1Q9NPA3 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MID1IP1Q9NPA3 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MID1IP1Q9NPA3 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MID1IP1Q9NPA3 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MID1IP1Q9NPA3 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MID1IP1Q9NPA3 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MID1IP1Q9NPA3 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MID1IP1Q9NPA3 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MID1IP1Q9NPA3 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MID1IP1Q9NPA3 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MID1IP1Q9NPA3 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MID1IP1Q9NPA3 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MID1IP1Q9NPA3 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MID1IP1Q9NPA3 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MID1IP1Q9NPA3 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MID1IP1Q9NPA3 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MID1IP1Q9NPA3 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
MID1IP1Q9NPA3 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
MID1IP1Q9NPA3 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
MID1IP1Q9NPA3 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MID1IP1Q9NPA3 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MID1IP1Q9NPA3 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MID1IP1Q9NPA3 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MID1IP1Q9NPA3 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MID1IP1Q9NPA3 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MID1IP1Q9NPA3 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MID1IP1Q9NPA3 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MID1IP1Q9NPA3 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MID1IP1Q9NPA3 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MID1IP1Q9NPA3 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MID1IP1Q9NPA3 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MID1IP1Q9NPA3 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MID1IP1Q9NPA3 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MID1IP1Q9NPA3 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MID1IP1Q9NPA3 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MID1IP1Q9NPA3 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MID1IP1Q9NPA3 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MID1IP1Q9NPA3 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MID1IP1Q9NPA3 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MID1IP1Q9NPA3 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MID1IP1Q9NPA3 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MID1IP1Q9NPA3 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MID1IP1Q9NPA3 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MID1IP1Q9NPA3 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MID1IP1Q9NPA3 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MID1IP1Q9NPA3 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MID1IP1Q9NPA3 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MID1IP1Q9NPA3 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MID1IP1Q9NPA3 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
MID1IP1Q9NPA3 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MID1IP1Q9NPA3 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MID1IP1Q9NPA3 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MID1IP1Q9NPA3 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MID1IP1Q9NPA3 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MID1IP1Q9NPA3 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MID1IP1Q9NPA3 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MID1IP1Q9NPA3 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MID1IP1Q9NPA3 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MID1IP1Q9NPA3 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MID1IP1Q9NPA3 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MID1IP1Q9NPA3 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MID1IP1Q9NPA3 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MID1IP1Q9NPA3 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MID1IP1Q9NPA3 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MID1IP1Q9NPA3 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MID1IP1Q9NPA3 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
MID1IP1Q9NPA3 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MID1IP1Q9NPA3 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MID1IP1Q9NPA3 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MID1IP1Q9NPA3 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MID1IP1Q9NPA3 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
MID1IP1Q9NPA3 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MID1IP1Q9NPA3 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MID1IP1Q9NPA3 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MID1IP1Q9NPA3 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MID1IP1Q9NPA3 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MID1IP1Q9NPA3 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MID1IP1Q9NPA3 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms