Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms