Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP55

BPIFA1, BPI fold-containing family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA1Q9NP55 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms