Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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