Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY71

LRRC3, Leucine-rich repeat-containing protein 3, humanhuman

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC3Q9BY71 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms