Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.4 ms