Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms