Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms