Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 NLRC3-202ENST00000359128 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 RERE-201ENST00000337907 8026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 MRVI1-201ENST00000423302 6126 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 SCOC-210ENST00000608372 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 YIPF6-201ENST00000374622 6134 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 ABR-202ENST00000302538 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 AMER3-202ENST00000423981 6172 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 TECTA-201ENST00000264037 6468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 SMAD2-203ENST00000402690 12075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms